肛瘘有分类，分成单纯性的、复杂性的，还分为高位肛瘘跟低位肛瘘。如果是单纯性低位的肛瘘，瘘管一般比较浅表，而且外口距离肛门比较近，可以在外面明显的摸到条索状硬条，瘘管非常好找，手术时间非常短，一般手术的时间在二十分钟以内可以完成，术后的恢复时间快，切口的愈合时间短。高位肛瘘或者复杂性肛瘘，因为瘘管位置偏高，而且瘘管不止一根，走行相对复杂，在术中医生需要仔细探查瘘管，防止因为瘘管或者内口遗漏而导致术后的复发，时间相对长一点，有可能半个小时到一个小时不等。